Palabras como optimización, reproducibilidad, estandarización, costes; resuenan en todos los laboratorios cómo básicas para llegar, no solo a entender todos y cada uno de nuestros procesos, si no, también para analizarlos y mejorar su rendimiento, y así obtener unos resultados fiables y significativos.
Empresas como la nuestra, Aplitech Biolab, ofrece a los clientes instrumentación específica de laboratorio capaz de cubrir un proceso de principio a fin.
A continuación, expondremos un ejemplo práctico de como nuestros equipos ayudan a mejorar y automatizar la producción de DNA plasmídico de calidad.
Desde la preparación de un cultivo celular (ej. células CHO) o microbiano (ej. E.Coli, levaduras,…), hasta la extracción y tratamiento de DNA/RNA de interés.
La necesidad de producción de DNA plasmídico de alto rendimiento ha aumentado significativamente debido, entre otros, a su aplicación en el campo de las vacunas de RNA mensajero, y las terapias génicas.
Maximizar la cantidad de DNA plasmídico se logra incrementando la concentración celular final y el número promedio de copias de plásmidos. Cómo esta relación es directa, las estrategias de fermentación se basan en el aumento de la densidad celular total.
Encontrar el punto óptimo de cada una de las cepas de E.Coli para un volumen, y unas condiciones concretas, por ejemplo, puede reducir costes de producción, y a su vez aumentar la cantidad de DNA plasmídico.
Según las condiciones de trabajo utilizaremos biorreactores Getinge (Applikon Biotechnology) la configuración del cual estará condicionada a nuestro cultivo, pudiendo elegir entre biorreactores de vidrio o Single Use (SU), en función de los requerimientos de esterilidad que establezcamos, además del volumen al que queramos trabajar (50ml a 20litros para escala laboratorio).
Los biorreactores ofrecen un control absoluto de las condiciones de trabajo
Desde la unidad de control gestionaremos parámetros, registraremos y conectaremos la vasija donde tendrá lugar el cultivo. Los controles de temperatura, oxígeno disuelto (DO), pH, y nivel, son automáticos, y se realizan a través de sondas invasivas, estableciendo cada uno de sus SetPoints en función del requerimiento de la bacteria, levadura, o línea celular que sigamos. Otras sondas como las de biomasa viable serán de ayuda para obtener más resultados de nuestro cultivo. Siempre podremos trabajar en cultivos Batch, fed-batch o continuo, en función de la línea celular, por lo tanto, de su punto de crecimiento exponencial, y de la concentración que queramos conseguir. La comparación entre cultivos de diferentes días, gracias a la recogida continua de datos, nos permitirá optimizarlo, reducir costes, y conseguir un mayor volumen celular.
Técnicas como la centrifugación o la filtración tangencial nos ayudaran a separar las diferentes partes del cultivo. Siendo en este caso de interés la biomasa de E.Coli.
Tras la recolecta realizamos la purificación de DNA plasmídico en la estación robótica liquid handling de Analytik Jena, CyBio Felix. Equipo de pequeñas dimensiones (60×75), con 12 posiciones de trabajo y capacidad para trabajar de 1 a 1536 muestras utilizando cabezales independientes, de 96 o 384. El kit que utilizaremos es el Wizard MagneSil Tfx™ System, 4 x 96 preps de PROMEGA.
El robot Cybio Felix al ser un equipo conocido como “plataforma abierta” permite la configuración de diferentes protocolos tales como: diluciones seriadas, stamping de placas, preparación de librerías NGS, normalización de placas y viales, lo hace un equipo versátil, y útil en nuestro laboratorio más allá de la aplicación descrita en este artículo.
Con el sistema de electroforesis se valorará la calidad del DNA plasmídico, llegando a valores de más de 250ng/µl de concentración.
Las estaciones robóticas liquid handling garantizan que los protocolos de pipeteo de laboratorio se realicen siempre de la misma manera, eliminando la incertidumbre añadida por la manipulación manual, ganando en reproducibilidad, eficiencia, precisión y estandarización. Así los resultados mostrados tienen siempre una base más sólida. Además, se favorece la reducción de costes operativos; y la seguridad en el manejo de la muestra, que incluye tanto la disminución de contaminaciones cruzadas, cómo la seguridad a la exposición de sustancias peligrosas de cara al usuario.
Eficiencia, precisión, estandarización
Estos son algunos de los equipos de instrumentación principales que ofrecemos como soluciones para la automatización de procesos. Esta automatización ayudará a entender mejor cada ensayo, a poder hacer comparaciones y tomar decisiones al respecto, incrementando la solidez de los resultados finales.
Poder ofrecer no solo la mejor tecnología, si no a los mejores profesionales en el mundo de la biotecnología, biología y la química, que te acompañarán a mejorar el rendimiento y la calidad en el laboratorio, es nuestra base y nuestra filosofía.
